装箱前及装货时应注意：设定的温度应正确;设定的新鲜空气换气量应正确;设定的相对湿度应正确;装箱时制冷系统应停止工作;箱内堆装的货物应低于红色装载线和不超出T型槽的垂直面;箱内堆装的货物应牢固、稳妥;箱内堆装货物的总重量应不超过冷箱大允许载重量;冷藏集装箱装货后总重量(包括附属设备的重量)在运输途中不应超过任一途经国的限重。
各种运输方式之间的交接可能出现短途运输或制冷系统故障，造成停止制冷。对冷冻和冷藏保鲜货物短时间地停止制冷状态是允许的。许多产品出现几小时的停止制冷可以接受，但并非所有货物都如此。对任何冷藏货物均不允许出现长时间地停止制冷。对特种货物和温度敏感货物应保持制冷系统连续工作，避免任何温度波动造成货物质量下降。
每个冷藏集装箱在交付使用前应对箱体、制冷系统等进行全面检查，冷藏集装箱清洁、无损坏、制冷系统处于佳状态。经检查合格的冷箱应贴有检查合格标签。根据不同易腐货物应确认下述事项：佳温度设定;新鲜空气换气量设定;相对湿度设定;运输总时间;货物体积;采用的包装材料和包装尺寸;所需的文件和单证等。