随着冷藏集装箱制冷与控制技术的发展和日臻完善，冷藏集装箱适装货物范围不断拓展，包括温度从-60℃的超级冷冻鱼到30℃的花球茎，温度控制偏差要求小于1℃的温度敏感货物，采用湿度、空气结构控制或调节保鲜的水果和蔬菜等，将货物以侍质量交付货主，延长上市保鲜期，提高经济效益。虽然冷藏集装箱现已具备多种完善地体质货物质量的功能，但货物正确的装箱前预处理，适当的包装和箱内堆装，特定的温度、湿度、新鲜空气换气量设置用空气结构控制或调节等都十分重要。如果做不好这些工作，将无法把货物保质保量地安全运抵目的地。

一般情况冷藏集装箱不应预冷，因为预冷过的冷藏集装箱一打开门，外界热空气进入冷藏集装箱遇冷将产生水汽凝结，水滴会损坏货物外包装和标签，在蒸发器表面凝结的水滴影响制冷量。但在冷库的温度与冷藏集装箱内温度一致，并采用“冷风通道”装货时，可以预冷集装箱。

堆码方式要使冷空气在包装材料和整件货物之间循环，带走呼吸产生的气体和热量，补充新鲜空气，有两种标准包装方法。 　　(1)无间隙积木堆放的货物应像堆放木材一样整体堆放，货物与箱壁之间不留间隙。如果装载的货物不能占据冷箱的整个底部，剩余区域应该用纸板或类似材料覆盖，这样可以防止空气流通“短路”，导致货物冷却不充分，箱内堆放的货物应低于红色装载线，不超出T型槽的垂直面，以冷空气的良好流通，货物上不得覆盖塑料薄膜等材料。 　　(2)托盘堆码法既要符合积木堆码法的要求，又要使托盘上堆码的箱子四角上下对齐，使重量均匀分布，箱子上下的通风孔要上下对齐，以便冷空气流通。