通常，冷藏集装箱容器的平均冷却速度为313℃/h空容器):但装货后，由于货物的热容量大，冷却谏度将大大降低，有时需要15-16小时才能达到设定的温度要求。如果输入温度很高，则需要2-3天才能达到设定温度。

使用二手冷藏集装箱运输时，安全稳定性非常重要。二手冷藏集装箱往往很重，人力拿不起，运输中满足加重设备和其他运输设备的要求。它也因为它的重量，往往会引起重心脏中运输设备的不稳定，所以在端角使用保护包装，以免容器被抓挠，引起变形。

在冷藏集装箱冷藏装置的操作期间，蒸发器盘管上会形成冰层，这取决于设定温度，货物温度，通风装置新鲜空气的数量以及货物的湿度等。制冷装置会定期进入除霜状态，由一系列的电加热装置产生热量或者向蒸发器盘管吹入热气。所有的风扇在此时会停止转动以防热气进入货舱。然而， 由于回风温度感应器位置接近制冷装置，此种温度升高可能会被记录下来。因此，除非经数据记录软件处理，否则温度记录将会呈现与除霜间隔时间一致的周期性温度升高。如果除霜期间短暂，每小时的温度读数和除霜期间可能会有一定出入。